ملا هبت‌الله آخوندزاده، رهبر طالبان به نهادهای امنیتی و کشفی این گروه دستور داده است که در جریان تحقیق و نظارت، نباید افراد متهم را مورد تعذیب و تعزیر قرار دهند.
او در این فرمان که منابع معتبر نسخه‌ای از آن‌را در اختیار روزنامه اطلاعات روز قرار داده‌اند، گفته است که برای کشف حقایق، متهم قضیه حداکثر ۱۰ روز در بند نگهداری شوند و برای بیشتر از این زمان، نیاز به حکم دادگاه است.
در این فرمان تذکر یافته است که اگر دادگاه حکم تمدید بازداشت متهم را صادر کند، بدون حکم دادگاه متهم هم نباید آزاد شود.
ملا هبت‌الله تأکید کرده است که در جریان تحقیق هیچ‌کسی حق تعذیب و تعزیر متهم را ندارد.
او گفته است که تعذیب و تعزیر از صلاحیت دادگاه است و نهادهای دیگر حق این عمل را ندارد و باید از اجرای آن خودداری کنند.
در این فرمان تاکید شده است که «آزار و اذیت عدالت نیست، بلکه ظلم است و جلوگیری از آن واجب و انجام‌اش حرام است».
این درحالی است که برخی از متهمان قضایای جنایی و کسانی که از سوی طالبان بازداشت می‌شوند، از «شکنجه و برخوردهای خشن» این گروه انتقاد دارند.
محمد (مستعار) یکی از نظامیان حکومت پیشین در ولایت دایکندی میگوید که استخبارات طالبان او را چندی پیش بازداشت و یک هفته در نظارت‌خانه نگهداری کرده است.
این نظامی پیشین میگوید که نیروهای طالبان در این مدت او را شبانه به‌شکل فجیع شکنجه می‌کردند، تا حدی که از هوش رفته است.
او میگوید که نیروهای طالبان با شکنجه از متهمان اعتراف می‌گیرند.
این نظامی پیشین می‌افزاید که حتا احتمال مرگ زیر شکنجه طالبان وجود دارد. به باور او، کسانی که توسط طالبان شکنجه می‌شوند، ممکن است دچار معلولیت و مشکلات صحی شوند.
اخیرا مواردی هم گزارش شده بود که افرادی از جمله نظامیان پیشین زیر شکنجه‌ی طالبان جان باخته‌اند. در آخرین مورد در هلمند، یک افسر پولیس حکومت پیشین توسط نیروهای طالبان در این ولایت بازداشت و پس از شکنجه‌ی شدید جان باخته است.