هم‌زمان با اخراج مهاجران از ایران، نمایندگی‌های این کشور در افغانستان بر صدور و مدت ویزا برای شهروندان افغانستان نیز محدودیت وضع کرده‌اند.
برخی از متقاضیان ویزای ایران می‌گویند که قنسولگری ایران در قندهار اعلام کرده است که پس از این ویزای هوایی دوماهه و زمینی ۴۵ روز صادر خواهد کرد.
به‌گفته‌ی متقاضیان، در گذشته ویزای هوایی ایران سه‌ماهه و زمینی دوماهه بود.
مسئول یکی از شرکت‌های سیاحتی می‌گوید که ثبت درخواست ویزای فامیلی نیز در نمایندگی قندهار منع شده است.
به‌گفته‌ی او، پیش از این در کابل هم سفارت ایران برای خانواده‌های بیشتر از سه نفر ویزا صادر نمی‌کرد.
متقاضیان ویزای ایران می‌گویند که صدور ویزا برای شهروندان افغانستان محدود شده و سایت‌های ثبت‌نام مسدود است و به‌گونه‌ی محدود باز می‌شود.
یکی از این متقاضیان می‌گوید که هزینه‌ی صدور ویزا از نمایندگی ایران در شمال افغانستان ۳۵ هزار افغانی است.
در حال حاضر، شهروندان افغانستان به سایت‌های ثبت‌نام درخواست ویزای ایران دسترسی ندارند و درخواست‌ها عمدتا از سوی شرکت‌ها ثبت می‌شود.
محدودیت بر صدور و مدت ویزا برای شهروندان افغانستان از سوی ایران در حالی است که این کشور مهاجران دارای برگه سرشماری را اخراج و از آنان می‌خواهند که با ویزا برگردند.
به‌دلیل بحران بیکاری و فقر، شهروندان افغانستان عمدتا برای کار به ایران می‌روند.